Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms