Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RBBP4Q09028 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms