Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DDR1Q08345 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms