Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL9Q07325 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXCL9Q07325 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CXCL9Q07325 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXCL9Q07325 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXCL9Q07325 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL9Q07325 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL9Q07325 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms