Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SOX4Q06945 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms