Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
GABPAQ06546 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GABPAQ06546 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms