Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CD164Q04900 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CD164Q04900 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CD164Q04900 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CD164Q04900 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CD164Q04900 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CD164Q04900 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CD164Q04900 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CD164Q04900 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CD164Q04900 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CD164Q04900 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CD164Q04900 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CD164Q04900 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CD164Q04900 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms