Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAV1Q03135 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms