Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms