Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms