Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLOD1Q02809 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms