Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPCQ01831 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPCQ01831 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPCQ01831 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPCQ01831 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPCQ01831 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPCQ01831 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
XPCQ01831 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPCQ01831 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPCQ01831 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
XPCQ01831 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPCQ01831 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPCQ01831 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPCQ01831 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPCQ01831 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPCQ01831 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPCQ01831 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPCQ01831 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPCQ01831 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPCQ01831 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPCQ01831 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPCQ01831 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPCQ01831 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPCQ01831 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPCQ01831 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPCQ01831 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPCQ01831 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
XPCQ01831 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPCQ01831 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
XPCQ01831 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPCQ01831 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPCQ01831 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPCQ01831 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPCQ01831 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPCQ01831 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPCQ01831 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPCQ01831 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPCQ01831 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPCQ01831 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPCQ01831 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPCQ01831 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPCQ01831 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPCQ01831 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPCQ01831 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
XPCQ01831 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPCQ01831 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPCQ01831 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
XPCQ01831 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPCQ01831 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPCQ01831 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPCQ01831 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPCQ01831 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPCQ01831 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPCQ01831 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPCQ01831 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPCQ01831 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPCQ01831 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPCQ01831 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms