Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms