Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms