Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL8P80075 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL8P80075 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL8P80075 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL8P80075 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL8P80075 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL8P80075 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL8P80075 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL8P80075 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL8P80075 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL8P80075 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL8P80075 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL8P80075 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL8P80075 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL8P80075 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL8P80075 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL8P80075 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL8P80075 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL8P80075 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL8P80075 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL8P80075 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL8P80075 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL8P80075 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL8P80075 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL8P80075 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL8P80075 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL8P80075 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL8P80075 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL8P80075 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms