Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRX1P78414 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IRX1P78414 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IRX1P78414 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX1P78414 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX1P78414 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX1P78414 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX1P78414 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX1P78414 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX1P78414 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX1P78414 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX1P78414 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX1P78414 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX1P78414 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX1P78414 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IRX1P78414 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms