Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms