Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms