Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB25P57735 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB25P57735 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms