Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2BFSP57053 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2BFSP57053 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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