Protein–RNA interactions for Protein: P56696

KCNQ4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ4P56696 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNQ4P56696 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ4P56696 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms