Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO3P55854 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms