Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NAPAP54920 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NAPAP54920 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAPAP54920 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAPAP54920 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAPAP54920 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAPAP54920 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAPAP54920 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAPAP54920 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAPAP54920 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAPAP54920 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAPAP54920 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAPAP54920 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAPAP54920 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAPAP54920 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAPAP54920 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAPAP54920 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAPAP54920 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAPAP54920 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAPAP54920 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAPAP54920 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAPAP54920 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NAPAP54920 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NAPAP54920 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAPAP54920 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAPAP54920 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAPAP54920 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAPAP54920 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAPAP54920 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAPAP54920 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAPAP54920 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NAPAP54920 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms