Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB4P54760 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB4P54760 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB4P54760 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB4P54760 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB4P54760 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB4P54760 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB4P54760 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB4P54760 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB4P54760 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB4P54760 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB4P54760 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB4P54760 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB4P54760 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB4P54760 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB4P54760 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EPHB4P54760 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EPHB4P54760 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EPHB4P54760 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EPHB4P54760 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB4P54760 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms