Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRAP54198 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRAP54198 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRAP54198 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRAP54198 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRAP54198 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRAP54198 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRAP54198 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRAP54198 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRAP54198 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRAP54198 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRAP54198 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIRAP54198 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIRAP54198 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
HIRAP54198 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIRAP54198 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIRAP54198 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIRAP54198 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIRAP54198 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRAP54198 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRAP54198 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRAP54198 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRAP54198 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRAP54198 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRAP54198 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRAP54198 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRAP54198 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRAP54198 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRAP54198 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRAP54198 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRAP54198 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRAP54198 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRAP54198 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRAP54198 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRAP54198 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRAP54198 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRAP54198 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRAP54198 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRAP54198 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRAP54198 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRAP54198 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRAP54198 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms