Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIMK2P53671 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms