Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPAP53621 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPAP53621 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPAP53621 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPAP53621 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPAP53621 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPAP53621 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPAP53621 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPAP53621 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPAP53621 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPAP53621 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPAP53621 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPAP53621 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COPAP53621 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPAP53621 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPAP53621 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPAP53621 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COPAP53621 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPAP53621 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COPAP53621 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPAP53621 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPAP53621 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPAP53621 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPAP53621 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPAP53621 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPAP53621 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPAP53621 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPAP53621 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COPAP53621 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms