Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP98P52948 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP98P52948 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP98P52948 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP98P52948 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP98P52948 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP98P52948 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP98P52948 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP98P52948 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP98P52948 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP98P52948 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP98P52948 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP98P52948 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP98P52948 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP98P52948 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP98P52948 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP98P52948 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP98P52948 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP98P52948 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP98P52948 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP98P52948 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP98P52948 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP98P52948 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP98P52948 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP98P52948 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP98P52948 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP98P52948 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP98P52948 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP98P52948 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP98P52948 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP98P52948 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP98P52948 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms