Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB28P51157 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB28P51157 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB28P51157 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB28P51157 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB28P51157 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB28P51157 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB28P51157 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB28P51157 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB28P51157 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB28P51157 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB28P51157 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB28P51157 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB28P51157 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB28P51157 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms