Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms