Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPIAP49247 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPIAP49247 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPIAP49247 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPIAP49247 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPIAP49247 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPIAP49247 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPIAP49247 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPIAP49247 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPIAP49247 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPIAP49247 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPIAP49247 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPIAP49247 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPIAP49247 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPIAP49247 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPIAP49247 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RPIAP49247 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPIAP49247 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPIAP49247 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RPIAP49247 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPIAP49247 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPIAP49247 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPIAP49247 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPIAP49247 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPIAP49247 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPIAP49247 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms