Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms