Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AFMP43652 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AFMP43652 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AFMP43652 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AFMP43652 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AFMP43652 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AFMP43652 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AFMP43652 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AFMP43652 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AFMP43652 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AFMP43652 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AFMP43652 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AFMP43652 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AFMP43652 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AFMP43652 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AFMP43652 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms