Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC1P41238 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms