Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGDSP41222 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms