Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL1P40616 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL1P40616 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL1P40616 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL1P40616 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL1P40616 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL1P40616 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL1P40616 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL1P40616 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL1P40616 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARL1P40616 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL1P40616 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL1P40616 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL1P40616 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL1P40616 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL1P40616 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL1P40616 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ARL1P40616 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ARL1P40616 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ARL1P40616 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARL1P40616 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms