Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFBP38117 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFBP38117 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFBP38117 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFBP38117 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFBP38117 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFBP38117 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFBP38117 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFBP38117 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFBP38117 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFBP38117 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFBP38117 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFBP38117 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFBP38117 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFBP38117 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ETFBP38117 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETFBP38117 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms