Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPARGP37231 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPARGP37231 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PPARGP37231 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPARGP37231 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPARGP37231 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPARGP37231 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPARGP37231 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPARGP37231 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPARGP37231 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms