Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms