Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms