Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms