Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms