Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF4P34130 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NTF4P34130 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NTF4P34130 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NTF4P34130 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NTF4P34130 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms