Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTX2P32243 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OTX2P32243 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OTX2P32243 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms