Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC13P31276 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC13P31276 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms