Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM4SF1P30408 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms