Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTF2E2P29084 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms