Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSSP25774 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSSP25774 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSSP25774 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSSP25774 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSSP25774 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSSP25774 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSSP25774 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSSP25774 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSSP25774 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSSP25774 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTSSP25774 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms