Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
YY1P25490 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
YY1P25490 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YY1P25490 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YY1P25490 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YY1P25490 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YY1P25490 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YY1P25490 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YY1P25490 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YY1P25490 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YY1P25490 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YY1P25490 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YY1P25490 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YY1P25490 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YY1P25490 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YY1P25490 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YY1P25490 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
YY1P25490 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YY1P25490 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YY1P25490 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YY1P25490 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YY1P25490 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YY1P25490 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YY1P25490 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YY1P25490 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YY1P25490 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
YY1P25490 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YY1P25490 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
YY1P25490 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YY1P25490 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YY1P25490 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YY1P25490 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YY1P25490 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YY1P25490 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YY1P25490 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YY1P25490 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
YY1P25490 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YY1P25490 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YY1P25490 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
YY1P25490 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
YY1P25490 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YY1P25490 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YY1P25490 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YY1P25490 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YY1P25490 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YY1P25490 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YY1P25490 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
YY1P25490 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YY1P25490 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
YY1P25490 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms