Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5F1P24539 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms